Eu também tenho este problema.

A configuração de resposta automática é para outra finalidade, tipo "obrigado por nos enviar um email e em breve responderemos".

O problema é que quando eu puxo o atendimento o sistema envia a mensagem " {{SALUTATION}} meu nome é {{AGENT}} em que posso ajudá-lo?"

Esta mensagem de atendimento iniciado não deveria ser enviada para o canal de email.

Opa, vc ja testou essa configuração entro dentro do canal e-mail?

O canal e-mail precisa é de um filtro spam. Isso não existe. Poderiam usar algum recurso do Google, sei lá. Os e-mails entram sem filtro. Retrabalho para o agente.